Connaissez-vous l'histoire du Jurassic Park de John P. Hammond ? Ancien PDG de la puissante compagnie InGen, il est parvenu à cloner des dinosaures, et décida tout simplement de les utiliser dans une sorte de parc zoologique, basé à Isla Nublar. Avant l'ouverture, une équipe d'experts fut chargée de s'assurer de la sécurité des lieux. Lors de cette visite, l'île essuie une violente tempête, tandis qu'un informaticien corrompu désactive les systèmes de sécurité, avant de voler des embryons de dinosaures. Pendant plusieurs heures, les dinosaures, alors libres de toute sécurité, parviennent à quitter leurs enclos. S'ensuit une terrible course-poursuite entre les différents dinosaures et les quelques personnes restées sur l'île. Finalement, quelques survivants parviennent à quitter Isla Nublar.

Bien peu de personnes furent mises au courant de ce qui se passa sur Isla Nublar. Et encore moins de ce qui se passa après. Quoiqu'il en soit, l'île est à présent recouverte de cendres, totalement stérile. Mais plus de vingt ans plus tard, InGen, par le biais de son nouveau PDG, décide d'envoyer une nouvelle équipe. Non pas sur place, mais sur une île voisine, Isla Oscura. Composée d'une cinquantaine de personnes, d'origines et métiers les plus divers, elle se prépare dans le plus grand secret. Son objectif ? Rejoindre Isla Oscura, et définir si oui ou non des dinosaures d'Isla Nublar auraient "migré" sur l'île voisine. L'équipe est également chargée de construire une base avancée, qui lui servira de Quartier Général. Depuis une vingtaine d'années, plus personne n'a mit le pied sur l'archipel. Qu'est ce que l'équipe trouvera-t-elle sur place ?